Ementas

BQI 600 – Bioquímica Geral 4(4-0) I

Proteínas e enzimas. Ácidos nucléicos e biossíntese de macromoléculas. Carboidratos, lipídios e membranas. Metabolismo celular.

Bibliografia:

1. NELSON, D. L.; COX, M. M. Lehninger Principles of Biochemistry. 5th ed. W. H. Freeman: New York, 2008. 1100p.

2. VOET, D.; VOET, J. G.; Bioquímica. 3nd ed. Artmed. São Paulo, 2006, 1596p.

3. BERG, J. M.; TYMOCZKO, J. L.; STRYER, L. Biochemistry. 6th ed. W. H. Freeman: New York, 2006. 1120p.

4. MURRAY, R. K.; GRANNER, D. K.; MAYES, P. A.; RODWELL, V. W. Harper’s Illustrated Biochemistry. 27th ed. McGraw-Hill Medical: New York, 2006. 672p.

5. Periódicos científicos da área.

BQI 601 – Métodos Bioquímicos 4(4-0) I

Medição e controle de pH. Métodos de análise e quantificação de macromoléculas. Métodos de purificação de macromoléculas

Bibliografia

1. HOLME, D. J.; PECK, H. Analytical biochemistry. 3a ed. New York: Longman, 1998. 488p.

2. LAKOWICZ, J. R. Principles of flourescence spectroscopy. 3a ed. Springer, 2006. 923p.

3. NELSON, D. L.; COX, M. M. Lehninger principles of biochemistry.5a ed. New York: Worth Publishers, 2008. 1158p.

4. WILSON, K.; WALKER, J. Principles and techniques of practical biochemistry. 5a ed. New York: Cambridge University Press. 2000. 784p.

5. WILSON, K.; WALKER, J. Principles and techniques of biochemistry and molecular biology. 5a ed. New York: Cambridge University Press. 2008. 771p.

6. Artigos Científicos da Área.

BQI 602 – Biossegurança 4(4-0) I

Biossegurança. Conceito de risco. Níveis e normas de biossegurança. Manuseio, armazenamento e descarte de agentes químicos e biológicos potencialmente patogênicos. Biossegurança na experimentação humana, animal e vegetal. Imunizações aplicadas a trabalhadores em áreas de risco biológico. Biossegurança em laboratórios de análise, ensino e pesquisa, hospitais, e no manuseio de animais. Equipamentos e desenho de laboratórios para diferentes níveis de biossegurança. Conduta e normas de biossegurança em caso de riscos e emergências. Transporte de amostras e substâncias biológicas.

Bibliografia

1. Organização Mundial da Saúde. Manual de segurança biológica em laboratório. 3a edição. Genebra. 2004.

2. Chosewood L.C. & Wilson D.E. Biosafety in microbiological and biomedical laboratories. 5th edition. Centers for Disease Control and Prevention. USA. 2009.

3. National Research Council. Occupational health and safety with infectious disease agents in research animals. Washington, DC, National Academy Presss. USA. 1997.

4. National Research Council. Guide for the care and use of laboratory animals. 8th Edition Washington, DC, National Academy Presss. USA. 247 pp. 2011.

5. National Research Council. Guidelines for the humane transportation of research animals. Washington, DC, National Academy Presss. USA. 168 pp. 2006.

6. National Research Council. Protecting the frontline in biodefense research: the special immunization program. Washington, DC, National Academy Presss. USA. 170 pp. 2011.

7. Collins CH & Kenedy DA. Laboratory Acquired infections: History, incidence, Causes and Prevention. 4th. Edition. Oxfod, 1999.

8. National Research Council. Biotechnology research in an age of terrorrism. .Washington, DC, National Academy Presss. USA. 134 pp. 2011.

9. United Nations. Recomendations on the transport of dangerous goods. 13th. revised edition. New York and Geneve. 2003.

10. National Research Council. Prudent Practices in the Laboratory: Handling and Management of Chemical Hazards. Washington, DC, National Academy Presss. USA. 360 pp. 2011.

11. World Health Organization. Transport of Infectious Substances. Geneve, 2004.

12. Kole C., Michler C., Abbott A.G., Hall T.C. Transgenic Crop Plants: Volume 2: Utilization and Biosafety. Springer. 516 pp. 2010.

13. Fleming D.O. & Hunt D.L. Biological Safety: Principles And Practices (Biological Safety: Principles & Practices). American Society for Microbiology. 622 pp. 2006.

14. Artigos científícos indexados de revistas da área.

BQI 610 – Bioenergética 4(4-0) II

Bioenergética quantitativa. Transdução da energia quimiosmótica. Cadeia respiratória mitocondrial. Força proton-motiva dos geradores fotossintéticos. ATP sintase. Transporte de íons e metabólitos através de membranas

Bibliografia

1. NELSON, D. L.; COX, M. M. LEHNINGER Principles of biochemistry. 6TH. Ed. New York, W. H. Freeman and Company, 2008. 1158p.

2. Nicholls, D. G.; Ferguson, S. J.Bioenergetics 3. Academic Press, London, 2002. 297p.

3. Revistas Científicas da Área.

BQI 620 – Enzimologia 4(4-0) II

Estruturas de enzimas. Enzimas como catalisadores biológicos. Classificação de enzimas. Cinética enzimática. Métodos para construção de gráficos dos dados de cinética enzimática. Inibição enzimática. Enzimas alostéricas e de sítios múltiplos. Purificação de enzimas.

Bibliografia

01. ALBERTS, B., BRAY, D., LEWIS, J., RAFF, M., ROBERTS, K., WATSON, J.D. Molecular biology of the cell. 4th edition, New York: Garland Publishing, 2003, 1661 p.

02. BERG, J. M.; TYMOCZKO, J. L.; STRYER L. Biochemistry. 6th edition. New York, NY: W.H. Freeman and Company, 2006, 1026p.

03. BEYNON, R.J., BOND, J.S. Proteolytic enzymes: a practical approach. IRL Press, Oxford, England, 1989, 259p.

04. DIXON, M., WEBB, E.C. Enzymes. New York: Academic Press, 1970. 1.116p.

05. EISENTHAL, R., DANSON, M.J. Enzyme assays: a pratical approach. IRL Press at Oxford University Press, Oxford, England, 1992, 351 p.

06. HOLME, D. J.; PECK, H. Analytical biochemistry. 3 edition, Singapore, Prentice Hall, 1998, 488p.

07. LEHNINGER, A.L., NELSON, D.L., COX, M.M. Principles of biochemistry. 4th .edition. New York, NY: W.H. Freeman and Company, 2005, 1.119p.

08. MURRAY, R. K.; GRANNER, D. K.; RODWELL, V. W. Harper’s Illustrated biochemistry. 27th edition. New York, NY: The McGraw-Hill Companies, Inc. 2006, 692p.

09. NEILANDS, J.B., STUMF, P.K. Princípios de enzimologia. Madrid: John Wiley & Sons, 1967. 437 p.

10. PASSONNEAU, J.V., LOWRY, O.H. Enzymatic analysis: a pratical guide. Humana Press, Totowa, N.J. 1993, 440p.

11. SEGEL, I.H. Enzyme kinetics. New York: John Wiley & Sons, 1975. 957 p.

12. Revistas Científicas da Área.

BQI 630 – Bioquímica Celular 4(4-0) II

A célula procariótica e eucariótica. Estrutura, composição e complexidade do genoma. Mecanismos genéticos. O fluxo da informação genética na célula. Expressão gênica em células eucarióticas. Controle da expressão de genes. Composição, estrutura e função de membranas. Conversão de energia: mitocôndrio e cloroplasto. Transdução de sinais celulares.

Bibliografia

01. ALBERTS, B., BRAY, D., LEWIS, J., RAFF, M., ROBERTS, K., WATSON, J.D. Biologia Molecular da Célula. 4. ed. Artmed, 2004, 1.549 p.

02. LEWIN, B. Genes VIII. Benjamin Cummings; US Ed edition (December 15, 2003), 1.056 p.

03. Mathews C.K., van Holde K.E. & Ahern K.G., Biochemistry. 3ª Ed. Redwood City, CA: The Benjamin Cummings Publ., 2000, 1.186 p.

04. WATSON, J.D., BAKER, T.A., BELL, S.P., GANN, A., LEVINE, M., LOSICK, R. Biologia Molecular do Gene. 5.ed. Artmed, 2006, 728 p.

05. Artigos Científicos da Área.

BQI 631 – Engenharia Genética de Plantas 4(4-0) II

Manipulação in vitro de ácidos nucléicos. Introdução do DNA recombinante na célula hospedeira e seleção de tipos recombinantes. Sequenciamento de DNA. Mutagênese in vitro. Reação de polimerização em cadeias (PCR). Construção e avaliação de bibliotecas genômicas e de cDNA. Organização do genoma vegetal. Regulação da expressão gênica em plantas. Estratégias gerais para isolamento de genes específicos. Construção de genes quiméricos para transformação de plantas. Obtenção de plantas transgênicas. Aplicações atuais e potenciais de plantas transgênicas. Aspectos éticos, legais e ecológicos da liberação e comercialização de material transgênico.

Bibliografia

01. SINGER, M.; Berg, P. Genes and genome: a changing perspective. Univ. Sci. Books, Mill valley, Ca. 1991.

02. ELLIOTT, W.H. ELLIOTT, D.C. Biochemistry and molecular biology. New York, Oxford University Press, 1997.

03. STRYER, L. Bioquímica. 3ª. Ed. Rio de Janeiro, Editora Guanabara Koogan, 1992.

04. HIATT, A. Transgenic plants. New York, CRC Press, 1993.

06. ARTIGOS SELECIONADOS EM:

Plant Molecular Biology

Plant Physiology

The Plant Cell

Annual Review of Genetics

Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology

Methods in Plant Biochemistry

Outros periódicos de interesse do curso

BQI 632 – Epidemiologia Molecular Aplicada a Agentes Infecciosos e Parasitários 4(4-0) II

Princípios de Epidemiologia Molecular. Métodos laboratoriais e convencionais utilizados em estudos epidemiológicos. Técnicas moleculares mais utilizadas para estudos de doenças infecciosas e parasitárias. Análise de padrões de eletroforese. Distinção de pathovars através de métodos moleculares. Análise de similaridade e relações entre cerpas. Vigilância epidemiológica e investigação de surtos. Doenças bacterianas emergentes. Doenças virais emergentes. Aplicação de métodos de tipagem baseados em seqüências. Análises de estudos epidemiológicos. Uso de softwares em epidemiologia molecular. Exemplos de epidemiologia molecular aplicada ao estudo de agentes infecciosos e parasitários em humanos, animais e plantas. Modelos de estudos epidemiológicos de infecções por microorganismos multi-resistentes.

Bibliografia

1. Arbeit, R D. Laboratory procedures for the epidemiologic analysis of microorganisms. In: Murray P R, Baron E J, Pfaller M A, Tenover F C, Yolken R H. , editors. Manual of clinical microbiology. 7th ed. Washington, D.C.: American Society for Microbiology; 1999.pp. 116-137.

2. Carington, M.; Hoelzel, A.R. Molecular epidemiology. Oxford University Press, 274 pp. 2001

3. Day, I.N.M. Molecular genetic epidemiology. A laboratory perspective. Springer, 227 pp. 2001.

4. Foxman, B and Riley, L.W. Molecular epidemiology: Focus on infection. American Journal of Epidemiology, 153:1135-1141. 2001.

5. Jongejan, F.; Goff, W.; Camus, E. Tropical Veterinary Medicine: Molecular epidemiology, hemoparasites and theirs vectors, and general topics. Annals of New York Academy of Sciences. 1998.

6. Levin, B.R. et all. Population biology, evolution, and infectios disease: convergence and synthesis. Science, 283:806-9. 1999.

7. Riley,L. W. Molecular epidemiology of infectious diseases: Principles and practices. ASM Press, 364 pp. 2004

8. Tenover, F.C. et al. How to select and interpret molecular strain tying methods for epidemiological studies of bacterial infections: a review for healthcare epidemiologists. Infection Control Hospital Epidemiology, 18:426-439. 1997.

9. Tibayrenc, M. Genetic epidemiology of parasitic protozoa and pther infectious agents: the need for an integrated approach. International Journal of Parasitology, 28:85-104. 1998.

10. Thompson, R.C.A. Molecular epidemiology of infectious diseases. Arnold Publishers, , 336 pp. 2000

11. Artigos científicos indexados de revistas da área

BQI 633 – Sinalização Celular 4(4-0) I

Aspectos gerais da comunicação celular. Vias de sinalização celular mediadas por receptores acoplados à proteínas G (GPCRs). Vias de sinalização celular mediadas por canais iônicos. Vias de sinalização celular mediadas por receptores associados a enzimas. Vias de sinalização celular que utilizam receptores intracelulares. Sinalização celular dependente de proteólise. Aspectos que diferenciam a biosinalização em microrganismos, plantas e animais. Integração entre sinais e vias de resposta.

Bibliografia

1. ALBERTS, JONSON, LEWIS, RAFF, ROBERTS and WALTER. Biologia Molecular da Célula. 4º Ed. 2004.1584 p.

2. LODISH et Ali., Molecular Cell Biology, W.H. Freeman and Company, 5th edition, 2004, 937p.

3. LEHNINGER, A.L., NELSON, D.L., COX, M.M. Principles of biochemistry. 4th .edition. New York, NY: W.H. Freeman and Company, 2005, 1.119p.

4. Artigos selecionados em periódicos científicos internacionais

BQI 640 – Bioquímica do Tecido Animal 4(4-0) I

Aspectos práticos da bioquímica de tecidos. Bioquímica das moléculas secretórias do aparelho digestório. Biomoléculas do sangue. Metabolismo nos tecidos hepático e renal. Bioquímica do cérebro. Funções bioquímicas dos tecidos de reserva e estruturais. Bioquímica hormonal. Controle metabólico e integração bioquímica dos tecidos.

Bibliografia

1. BAYNES, J.; DOMINICZAK, M. H. Medical biochemistry. 3rd. ed. Mosby: New York, 2009. 712p.

2. BENDER, D. A. Introduction to nutrition and metabolism. 4th. ED. CRC: New York, 2007. 440p.

3. DEVLIN, T. M. Textbook of biochemistry with clinical correlations and with human molecular genetics. 6th. ed. Wiley-Liss: New York, 2006. 1896p.

4. GIBSON, D. M.; HARRIS, R. A. Metabolic regulation in mammals. CRC: New York, 2001. 240p.

5. METZLER, D. E.; METZLER, C. M. Biochemistry: the chemical reactions of living cells. 2nd. Ed. Vol. 2. Harcourt/Academic Press: New York, 2002. 960p.

6. METZLER, D. E.; METZLER, C. M.; SAUKE, D. J. Biochemistry: the chemical reactions of living cells. 2nd. Ed. Vol. 1. Harcourt/Academic Press: New York, 2001. 937p.

7. MURRAY, R. K.; BENDER, D. A.; BOTHAM, K. M.; KENNELLY, P. J.; RODWELL, V. W.; WEIL, P. A. Harper’s illustrated biochemistry. 28th. ed. MCGRAW-HILL MEDICAL: New York, 2009. 704p.

8. VANCE, D. E.; VANCE, J. Biochemistry of lipids, lipoproteins and membranes. 5th. ed. Elsevier Health Sciences: New York, 2008. 624p.

9. Revista Científica da Área

BQI 641 – Bioprospecção de Metabólitos Secundários de Plantas 4(4-0) I

Bioprospecção de metabólitos secundários vegetais bioativos. Acesso à biodiversidade. Bioquímica analítica de metabólitos secundários. Organização celular de plantas. Biossíntese de metabólitos secundários. Influência de fatores edafoclimáticos na biossínteses de metabólitos secundários visando à aplicação biotecnológica. Metabólitos secundários de interesse biotecnológico. Tecnologia de produção de fitoderivados. Aspectos legais sobre acesso a biodiversidade.

Bibliografia

1. BRUNETON, J. Pharmacognosie, phytochemie, plantes médicinales. 2ed. Paris: Lavoisier, 1993. 915p.

2. CUNHA, A.P. DA SILVA, A.P.; ROQUE, O.R. Plantas e produtos vegetais em fitoterapia. Lisboa: Fundação Calouste Gulbenkian, 2003. 701p.

3. DEWICK, P.M. Medicinal natural products. A biosynthetic approach. 2 ed. West Sussex: John Wiley & Sons, 2001. 507p.

4. FETROW, C.W.; AVILA, J.R. Manual de medicina alternativa. Rio de Janeiro: Guanabara-Koogan, 1999. 743p.

5. LEHNINGER, A.L., NELSON, D.L., COX, M.M. Princípios de Bioquímica. 4 ed. São Paulo: Sarvier, 2006. 1.202p.

6. LEITE, J. P. V. Fitoterapia: báses científicas e tecnológicas. São Paulo: Athenu, 2008.

7. MANN, J. Secondary Metabolism. 2 ed. Oxford: Oxford University Press, 1987. 374p.

8. SIMÕES, C.M.O.; SCHENKEL, M.K.; GOSMANN, G.; MELLO, J.C.P.; MENTZ, L.A.; PETROVICK, P.R. Farmacognosia da planta ao medicamento. 2ed. Porto Alegre: UFRGS, 1999. 821p.

9. SHARAPIN, N. Fundamentos de tecnologia de produtos fitoterápicos. Santafé de Bogotá: Roberto Pinzón, 2000. 248p.

10. WILLIAMSON, E.M.; OKPAKO, D.T.; EVANS, F.J. Selection, preparation and pharmacological evaluation of plant material. West Sussex: John Wiley & Sons, 1996. 228p.

11. SCHULZ, V.; HANSEL, R.; TYLER, V.E. Fitoterapia racional: um guia de fitoterapia para as ciências da saúde. Barueri: Manole Ltda, 2001. 386p.

12. World Health Organization. Quality control methods for medicinal plant material. Genebra: WHO, 1998. 115p.

13. Artigos de periódicos da área.

BQI 642 – Bioquímica Ecológica 4(4-0) II

Metabolismo básico e origem dos metabólitos secundários. Importância dos metabólitos secundários. Comunicação química, defesa construtiva/defesa adaptativa. Adaptação bioquímica das plantas ao meio ambiente. A bioquímica da polinização. Interação bioquímica entre planta-microrganismo. Interação bioquímica entre planta-planta. Interação bioquímica entre planta-inseto. Interação bioquímica entre planta-vertebrado. Toxinas de plantas e seus efeitos em animais.

Bibliografia

1. AGRAWAL, A. A.; TUZUN, S. & BENT, E. Induced plant defenses against pathogens and hebivores: Biochemistry, ecology, and agriculture. American Phytopathological society. 2009. 390.

2. HUANG, J. S. Plant pathogenesis and resistance: biochemistry and physiology of plant-microbe interactions. Springer. 2001. 708p.

3. INZE, D. & MONTAGU, M. V. Oxidative stress in plants. CRC Press. 2001. 336p.

4. KARBAN, R. & BALDWIN, I.T. Induced responses to herbivory (Interspecific interactions). University of Chicago Press. 1997. 330p.

5. RONALD, P.C. Plant-pathogen interactions. Humana press. 2006. 283p.

6. TUZUN, S. & BENT, E. Multigenic and induced systemic resistance in plants. Spinger US. 2005. 521p.

7. Walters, D.; A. Lyon, G.; REGLINSKI, T. Induced resistance for plant defense: a sustainable approach to crop protection. Wiley-Blackwell. 2007. 272p.

8. Artigos de periódicos da área.

BQI 645 – Bioquímica da Nutrição 4(4-0) II

Energia e metabolismo basal. Regulação metabólica. Bioquímica da nutrição em indivíduos normais. Bioquímica da nutrição dos estados especiais. Bioquímica da nutrição na terapêutica. Metabolismo dos nutrientes nas doenças. Bioquímica da nutrição esportiva. Novas perspectivas em alimentos funcionais.

Bibliografia

01. BRODY, T. Nutritional biochemistry. London: Academic Press, 1993, 658 p.

02. BUSNELLO, F.B. Aspectos nutricionais no processo do envelhecimento. Atheneu, São Paulo. 2007. 314p

03. CAMPBELL, M.; FARREL, S.O. Bioquímica, VOL I e Vol II. Editora Thompson. 2007. 250p

04. CAMPBELL, M.; FARREL, S.O. Bioquímica – Bioquímica metabólica, Vol III. Editora Thompson. 2007. 316p

05. HIRSCHBRUSCH, M. C.; CARVALHO, J. R. Nutrição esportiva. 1ª ed. Ed. Nande Ltda. 2002. 345p

06. LEHNINGER, A. L., NELSON, D. L., COX, M. M. Principles of biochemistry. 4th edition. New York, NY: W. H. Freeman and Company, 2005. 1.119p.

07. MURRAY, R. K.; GRANNER, D. K.; RODWELL, V. W. Harper’s illustrated biochemistry. 27th edition. New York, NY: The McGraw-Hill Companies, Inc. 2006, 692p.

08. NETO, F. T. Nutrição clínica. 1ª ed., Guanabara Koogan. 2003. 518 p

09. PENTEADO, M.V. C. Vitaminas – aspectos nutricionais, bioquímicos, clínicos e analíticos. Editora Manole, Baueri, SP. 2002. 600p

10. RIEGEL, R. E. Bioquímica nutricional do Exercício Físico. Editora Unisinos. 2005. 462p

11. SMITH, C.; MARKS, A.D.; LIEBERMAN, M. Bioquímica médica básica de marks. Artmed, São Paulo, 2 ª ed. 2007. 992p

12. STUMP, S.S. Nutrição relacionada ao diagnóstico e tratamento. Editora Manole: Baueri, SP. 5ª ed. 2007. 880p

13. TIRAPEGUI, J. Nutrição, metabolismo e suplementação na atividade física. Atheneu. 20005. 368p

14. WIDMAIER, E.P.; RAFF, H.; STRANG, K.T. Vander’s human physiology. The mechanisms of body function. 10th ed. McGraw-Hill, 2006.

15. WOLISISKY, I., HIVKISON Jr, J. F. Nutrição no exercício e no esporte. 2ª ed. Editora Roxa. 2002. 646p

16. Revistas Científicas da Área

BQI 650 – Estruturas e Funções de Proteínas 4(4-0) II

Estruturas de proteínas. Técnicas para o estudo de proteínas. Maturação de proteínas. Enovelamento de proteínas. Predição e desenho de proteínas. Determinação da estrutura conformacional de proteínas. Estabilidade, desnaturação e inativação de proteínas. Grupos de proteínas.

Bibliografia

1. ALFENAS, A.C. (Ed.) Eletroforese de Isoenzimas e Proteínas Afins – Fundamentos e aplicações em plantas e microrganismos ­ 2ª. edição. Viçosa, Editora UFV, 2006. 574p.

2. BRANDEN, C. & TOOZE, J. Introduction to protein structure. 2nd ed. Garland Publishing, Inc., New York, 1999. 410p.

3. CREIGHTON, T.E. Proteins – structures and molecular principles. New York, W.F. Freeman and Company, 1984. 515p.

4. CREIGHTON, T.E. (Ed.) Protein structure – a pratical approach.Oxford, Oxford University Press, 1990. 355p.

5. CREIGHTON, T.E. (Ed.) Protein function – a pratical approach. Oxford, Oxford University Press, 1997. 334p.

6. DEUTSCHER, M.P. (ed.). Methods in Enzymology – Guide to protein purification, vol. 182, Academic Press, San Diego, 1990.

7. FÁGÁIN, C.O. Stabilizing protein function. Spring-Verlag, Berlin, 1997. 200p.

8. FARFÁN, J.A. Química de proteínas – aplicada à ciência e tecnologia dos alimentos. 2ª ed. Editora da UNICAMP, Campinas, 1994. 134p.

9. HANDBOOKS – COLEÇÃO AMERSHAM PHARMACIA BIOTECH: 1) Protein Purification (18-1037-46); 2) Ion Exchange Chromatography – Principles and Methods (18-1114-21); 3) Affinity Chromatography – Principles and Methods (18-1022-29); 4) Hydrophobic Interaction Chromatography – Principles and Methods (18-1020-90); 5) Gel Filtration – Principles and Methods (18-1022-18); 6) Reversed Phase Chromatography – Principles and Methods (18-1134-16); 7) Chromatofocusing – with Polybuffer and PBE (18-1009-07). BERKELMAN, T. and STENSTEDT, T.; 8) 2-D electrophoresis using immobilized pH gradients – principles & methods, 1998 (80-6429-60).

10. JANSON, J.-C. and RYDÉN, L. Protein purification – principles, high resolution methods, and applications. 2nd ed., New York, John Wiley & Sons, Inc., 1998. 695p.

11.LEHNINGER, A.L., NELSON, D.L., COX, M.M. Principles of biochemistry. 4th .edition. New York, NY: W.H. Freeman and Company, 2005, 1.119p.

BQI 700 – Estruturas e Funções de Macromoléculas 4(4-0) II

Estruturas e funções de carboidratos e métodos de análise. Estruturas, funções e propriedades de lipídios. Estruturas e funções de proteínas e enzimas. Estruturas e funções  de ácidos nucleicos.

Bibliografia

01. ALBERTS, B.; JOHNSON, A.; LEWIS, J.; MORGAN, D.; RAFF, M.; ROBERTS, K. Molecular biology of the cell. 6th edition. Baltimore: Garland Science, 2014, 1464p.

02. GUR, M.I.; HARWOOD, J.L. & FRAYN, K.N. Lipid biochemistry: an introduction. 5th ed. Oxford: Blackwell Science Ed., 2002, 320p.

03. METZLER, D. E. Biochemistry: the chemical reactions of living cells. 2nd edition. New York: Academic Press, 2006, 1973p.

04. NELSON, D. L., COX, M. M. Lehninger principles of biochemistry. 6th edition. New York: W.H. Freeman and Company, 2012, 1340p.

05. Vance, D.E. & Vance,J.E. (Eds.) Biochemistry of lipids, lipoproteins and membranes. 4th ed. New York: Elsevier Science Publishing Co. Inc, 2002, 597p.

06. WATSON, J.D., BAKER, T.A., BELL, S.P., GANN, A.A.F, LEVINE, M., LOSICK, R.M. Molecular Biology of the Gene, 7th edition. Benjamin Cummings, 2013, 912p.

07. LINDHORST, T.K. Essential of carbohydrate chemistry and biochemistry, 3th edition. Wiley-VCH, 2006, 317p.

08. Revistas Científicas da Área

BQI 701 – Espectrometria de Massas Aplicada à Análise de Biomoléculas 4(4-0) I

Espectrometria de Massas. Analisadores de Massas. Sequenciamento e Identificação de Peptídeos e Proteínas. Técnicas de Separação Multidimensional e MS. Quantificação de Proteínas por MS. Ferramentas de Bioinformática. Análises de Metabólitos por LC/MSn. Análises de Lipídios e Ácidos Nucleicos.

Bibliografia:

1. Hoffmann, Edmond de. Mass spectrometry: principles and applications. ed. Edmond de Hoffmann, Vincent Stroobant. 2007. 3rd. 502p.

2. J. THROCK WATSON and O. DAVID SPARKMAN. Introduction to mass spectrometry instrumentation, applications and strategies for data interpretation. 2007. 4th Ed. 862p.

3. Timothy D. Veenstra; John R. Yates. Proteomics for biological discovery. By John Wiley & Sons. 2006. 2th Ed. 360p.

4. Sudhir Srivastava.Informatics in proteomics.By Taylor & Francis Group, LLC. 2005. 2th Ed. 436p.

5. T. Hanai. HPLC: A practical guide. The Royal Society of Chemistry. Cambridge, UK. 1999. 134p.

6. Artigos Científicos da área.

BQI 730 – Bioquímica de Ácidos Nucléicos 4(4-0) I

Estruturas de ácidos nucleicos. Análise de ácidos nucleicos. Interações entre ácidos nucleicos e proteínas. Genoma de eucariotos: organização do cromossomo. Síntese do DNA-replicação da cromatina. Controle de transcrição em eucarioto. Processamento do RNA e controle pós-transcricional. RNA regulatório. Regulação da biossíntese de proteínas. Sinalização celular.

Bibliografia

1) Harvey Lodish, Arnold Berk, Paul Matsudaira, Chris, A. Kaiser, Monty Krieger, Matthew P. Scott, S. Lawrence Zipursky and James Darnell. Molecular Cell Biology. 7th Edition; H. Freeman and Company. New York, 2012, 973 p.

2) Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts and Peter Walter Molecular Biology of the Cell. 6th Edition; Garland Science, Taylor and Francis Group. New York, 2014. 1464 p.

3)  Jocelyn E. Krebs, Elliott S. Goldstein and Stephen T. Kilpatrick Lewin’s – Genes XI. 11 Ed, Jones & Bartlett Leaming. 2012. 940 p.

4) James D. Watson, Tania A. Baker, Stephen P. Bell, Alexander Gann, Michael Levine and Richard Losick. Molecular Biology of the Gene. 7th edition; Benjamin Cummings. 912 p. 2013.

5) Donald Voet. Judith G. Voet. Biochemistry. 4rd Edition; Wiley. 1428 p. 2010.

6) Artigos do ano corrente e selecionados de periódicos da área, tais como: Cell, Nature, The Journal of Biological Chemistry, Genes and Development, Science, Plant Cell, PNAS etc.

BQI 735 – Filogeografia Molecular Experimental 4(3-2) I

Filogeografia molecular: uma nova disciplina. Estratégias de amostragem para estudos filogeográficos. Preparo de bancos de dados moleculares. Preparo de bancos de dados georeferenciados. Medidas de diversidade e testes de neutralidade. Análises por estatística bayesiana. Análise de variância molecular. Genealogia de genes. Análises por redes de haplótipos. Estimativas bayesianas de tempo de divergência. Perspectivas filogeográficas regionais. Aplicações da Filogeografia.

Bibliografia:

1. Avise JC. 2000. Phylogeography. Harvard University Press

2. Freeland JR. 2005. Molecular Ecology. John Wiley & Sons, Ltd

3. Carvalho CJB, Almeida EAB. 2011. Biogeografia da América do Sul: Padrões e Processos. Editora Roca Ltda

4. Pennington RT, Lewis GP, Ratter JA. 2006. Neotropical Savannas and Seasonally Dry Forests: Plant diversity, biogeography, and conservation. CRC Press

5. Artigos científicos de revistas especializadas da temática da disciplina

BQI 760 – Bioinformática I 4(2-2) I

Ambiente Linux. Obtenção e estrutura de dados gerados por tecnologias de sequenciamento de genomas e transcriptomas. Análise e triagem de qualidade de sequências. Algoritmos de montagem de genomas e transcriptomas. Algoritmos de anotação de genomas e transcriptomas. Estratégia de análise de genes diferencialmente expressos em transcriptomas. Obtenção de dados gerados por proteômica quantitativa livre de gel. Análise de proteínas diferencialmente expressas. Obtenção de dados gerados por metabolômica. Análise qualitativa e quantitativa de metabólitos em amostras complexas.

Bibliografia:

1. LESK, A. Introduction to Bioinformatics. 2nd Edition.Oxford. 2008. 390p.

2. XIONG, J. Essential bioinformatics. Cambridge University Press. USA. 2008. 339 p.

3. VERLI, H. Bioinformática da biologia à flexibilidade molecular. Porto Alegre. 2014. 282p. Disponível gratuitamente em: http://www.ufrgs.br/bioinfo/ebook/

4. MOREIRA, L. M. Ciências genômicas: Fundamentos e aplicações. 2016. Disponível gratuitamente em: http://moreiralab.net

5. Tutoriais ‘on-line’ na Internet sobre predição e análise de sequências de biomoléculas.

6. Artigos científicos selecionados.

BQI 761 – Bioinformática II 4(2-2) II

Análise comparativa de dados gerados pelas técnicas ômicas e biologia de sistemas. Programação em R. Análise de sequências em larga escala. Técnicas de agrupamento não supervisionado aplicado a ômicas. Análise comparativa de dados gerados pelas técnicas ômicas e biologia de sistemas. Técnicas de classificação supervisionada aplicada a ômicas. Redes biológicas moleculares. Biologia de sistemas.

Bibliografia:

1. XIONG, J. Essential bioinformatics. Cambridge University Press. USA. 2008. 339 p.

2. WALHOUT, M. Handbook of Systems Biology – Concepts and Insights. Academic Press. 2012. 552 p.

3. VERLI, H. Bioinformática da biologia à flexibilidade molecular. Porto Alegre. 2014. 282p. Disponível gratuitamente em: http://www.ufrgs.br/bioinfo/ebook/

4. Tutoriais ‘on-line’ na Internet sobre predição e análise de sequências de biomoléculas.

5. Artigos científicos selecionados.

ENT 662 – Fisiologia de Insetos 3(3-0) I

Física e fisiologia: problemas de escala. Desenvolvimento pós-embrionário. Metamorfose. Integumento. Esclerotização de cutícula. Regulação endócrina de muda e metamorfose. Relações endócrinas entre hospedeiros e parasitóides. Reprodução de insetos. Diapausa. Ritmos biológicos. Recepção sensorial. Sistema nervoso. Vôo. Migração. Nutrição e digestão. Estresse oxidativo e mecanismos antioxidantes. Hemolinfa. Sistemas imunológico, circulatório e traqueal e troca gasosa. Regulação de temperatura. Excreção e regulação de água e sais. Secreções de ataque e defesa.

Bibliografia:

01. Bourtzis, K. & T. Miller (Eds.) 2003. Insect Symbiosis. CRC, Boca Raton, FL. 353 p.

02. Brodsky, A.K. 1997. The Evolution of Insect Flight. Oxford University, Oxford. 248p.

03. Burrows, M. 1996. Neurobiology of an Insect Brain. Oxford University, Oxford. 682p.

04. Chapman, R.F. 1998. Insects: Structure and Function. Cambridge University, 4a ed., Cambridge. 800p.

05. Chown, S.L. & Nicolson, S.W. 2004.Insect Physiological Ecology: Mechanisms and Patterns. Oxford University, Oxford. 243p.

06. Christensen, T.A. (Ed.) 2005. Methods in Insect Sensory Neuroscience. CRC, 464p.

07. Drosopoulos, S. & Claridge, M. (Eds.) 2005. Insect Sounds and Communication. CRC, 560p.

08. Gilbert, L.I., Iatrou, K. & Gill, S.S. 2005. Comprehensive Molecular Insect Science, 7 vol. Elsevier, St. Louis, MO. 3300p

09. Heinrich, B. 1996. Thermal Warriors: Strategies if Insect Survival. Harvard University, Cambridge. 221p.

10. Klowden, M.J. 2002. Physiological Systems in Isects. Acadeic, San Diego. 415p.

11. Korsloot, A.; vas Gestel, C.A.M. & van Straalen, N.M. 2004. Environmental Stress and Cellular response in Arthropods. CRC, 208p.

12. Nation, J.L. 2002. Insect Physiology and Biochemistry. CRC, Boca Raton. 495p.

13. Nijhout, H.F. 1994. Insect Hormones. Princeton University, Princeton, 280p.

14. Periódicos científicos da área

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